La FLAPPSIP se crea con la convicción de que el intercambio científico y el conocimiento mutuo entre las instituciones participantes, así como entre sus miembros redundará en beneficio para todos. Constituye ésta una forma de integración de sus miembros latinoamericanos afianzando las raíces comunes y proyectándose hacia el futuro.

Tiene como propósitos:

Difundir el pensamiento psicoanalítico y sus diversas prácticas.

Proveer un espacio para el intercambio científico de las asociaciones componentes.
Proveer un espacio de reflexión y debate sobre problemas pertinentes a la formación y la asociación analítica.
Promover la cooperación científica entre las asociaciones componentes.

Propiciar la afiliación a esta Federación de otras asociaciones afines de los países de Latinoamérica.
Establecer el intercambio con otras instituciones afines de carácter internacional.
Promover eventos tales como: congresos, simposios, jornadas, encuentros y publicaciones.